Po spuštění program kontroluje CRC32 externí komprimační utility UPX.EXE pokud kontrolní součet nesouhlasí je zde podezření na poškození obsahu nebo infekci souboru. O této chybě vypsáno informační hlášení utilita je smazána a nově vygenerována z interního úložiště které je součástí programu. Program se pak normálně spustí.

 

Pokud se nepodaří smazání infikovaného souboru je již soubor chráněn infikovaným OS a pro vyřešení tohoto je potřebné použití vašeho antivirového programu. Program UPX .EXE Compressor proto deaktivuje všechny volby spojené s použitím této utility a tyto zůstávají neaktivní až do vyřešení problému infikovaného souboru (jeho odstranění) a restartu programu. Program nově vygeneruje utilitu z interního úložiště a poté se normálně spustí.


Dále je program chráněn technologií RunInIDE proti nežádoucí modifikaci.